學校現有5個國家一流本科專業建設點——臨床醫學、預防醫學、法醫學、藥學、護理學。5個國家級特色專業建設點。臨床醫學（五年制）、臨床醫學（農村定向免費生）、護理專業為教育部首批國家“本科教學工程”地方高校本科專業綜合改革試點專業。學校設有臨床醫學（五年制、“5+3”一體化）、預防醫學、法醫學、口腔醫學、兒科學、醫學影像學、麻醉學、護理學、精神醫學、眼視光醫學、藥學等29個本科專業（本科專業詳情見下表）。
| 基礎醫學 |
| 臨床醫學 |
| 麻醉學 |
| 醫學影像學 |
| 眼視光醫學 |
| 精神醫學 |
| 兒科學 |
| 口腔醫學 |
| 預防醫學 |
| 法醫學 |
| 臨床藥學 |
| 藥學 |
| 智能醫學工程 |
| 醫學檢驗技術 |
| 醫學影像技術 |
| 生物醫學工程 |
| 生物制藥 |
| 中藥學 |
| 醫學實驗技術（汾） |
| 眼視光學（汾） |
| 康復治療學 |
| 衛生檢驗與檢疫 |
| 護理學 |
| 助產學（汾） |
| 信息管理與信息技術 |
| 公共事業管理 |
| 健康服務與管理（汾） |
| 社會工作 |
| 運動康復 |