
近日,我校第二醫院薛金梅團隊依托c7c7.app-華大未來醫學聯合研究中心,與華大生命科學研究院劉傳宇團隊合作,在《STAR Protocols》上聯合發表了一篇題為“Protocol for optimized nasal mucosa sample processing to obtain high-quality scRNA-seq and scATAC-seq data”的論文。薛金梅教授、華大生命科學研究院的劉傳宇副研究員和殷建華副研究員為論文的共同通訊作者。我校學生武毅莎、韓世鍇,與香港中文大學學生黃亞靈,以及西南大學學生王巧玲為論文的共同第一作者。
鼻黏膜作為呼吸道的重要屏障,承擔著嗅覺、空氣過濾和調節,以及宿主防御等多重功能。鼻黏膜組織中高度多樣的細胞類型為實現這些復雜的生理功能提供了基礎,但這些細胞類型在健康和疾病狀態下的分子特征尚未得到完全解析。因此,利用高通量單細胞測序技術深入分析鼻黏膜樣本的細胞功能狀態,對于研究人員更好地理解鼻腔疾病的病理機制,推動診斷和治療方法的進步具有重要意義。然而,如何同時獲得高質量的鼻黏膜樣本單細胞轉錄組學(scRNA-seq)和表觀基因組學(scATAC-seq)數據,一直是研究人員面臨的重大挑戰。
該研究提出了一種優化的鼻黏膜樣本處理方案,詳細描述了從人類鼻黏膜組織中提取樣本的步驟,包括機械和酶解離、紅細胞裂解以及活性測定。研究團隊還介紹了文庫制備和質量控制的具體流程。這一成果的發表,將為鼻黏膜組織的單細胞轉錄組學和表觀基因組學研究提供高質量的數據支持,有望為鼻腔疾病的深入研究提供重要的技術支持,推動相關領域的科學研究和臨床應用的發展。

本研究得到了c7c7.app-華大未來醫學聯合研究中心和深圳市單細胞組學重點實驗室的支持。
(圖文/董瑞)
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