近日,我校生理學(xué)系/細胞生理學(xué)教育部重點實驗室曹濟民教授團隊在中國科學(xué)院一區(qū)top期刊《International Journal of Biological Macromolecules》(IJBM)連續(xù)發(fā)表了題為“Crystal structure of F10 core protein from Mpox virus reveals its potential inhibitors”(2025 Jan; 284(Pt 1):138079. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2024.138079)和“Structure-based discovery of dual-target inhibitors of the helicase from Bagaza virus”(2025 Jan 5, online ahead of print. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.139536)的兩篇研究論文,分別成功解析了猴痘病毒F10核心蛋白和巴加扎病毒解旋酶的晶體結(jié)構(gòu),并依據(jù)蛋白結(jié)構(gòu),篩選出了相關(guān)抗病毒藥物。IJBM為生物大分子研究領(lǐng)域的經(jīng)典國際期刊,目前為中國科學(xué)院一區(qū)top期刊,IF=7.7。在這兩篇論文中,博士研究生趙蓉均為第一作者,曹濟民教授、周鑫教授和王德平教授為共同通訊作者。
1. 猴痘病毒(MPXV)F10核心蛋白的結(jié)構(gòu)解析及抑制劑篩選。MPXV是痘病毒科的一種DNA病毒,感染人體后引起猴痘。猴痘具有很高的傳染性,并有一定的致死性,但尚無有效治療藥物。目前已報告了15600多例人猴痘病例和537例死亡病例。MPXV的RNA聚合酶(RNAP)由RNAP核心酶和病毒早期轉(zhuǎn)錄因子(VETF)、核苷三磷酸磷酸水解酶(NPH-I)、RNA聚合酶相關(guān)蛋白(Rap94)和F10核心蛋白等因子組成,負責(zé)猴痘DNA的早期轉(zhuǎn)錄。二聚體F10核心蛋白可穩(wěn)定Rap94的N端區(qū)域和NPH-I的C端結(jié)構(gòu)域,從而增強RNAP復(fù)合物的穩(wěn)定性。該工作以1.5 Å的高分辨率解析了F10核心蛋白的晶體結(jié)構(gòu),并將MPXV F10核心蛋白與已解析的痘苗病毒(VACV) RNAP的結(jié)構(gòu)進行比對,確定了F10核心蛋白與NPH-I結(jié)合的空腔。針對該空腔進行了靶向F10核心蛋白的抗病毒藥物虛擬篩選,發(fā)現(xiàn)28種化合物可作為潛在的MPXV抑制劑,首次篩選了靶向RNAP的抗MPXV藥物,該研究提供了一種開發(fā)抗猴痘藥物的新技術(shù)路徑。

圖 1. MPXV F10在RNAP中的作用機制及針對F10篩選MPXV抑制劑的策略
2. 巴加扎病毒(BAGV)解旋酶(helicase)的晶體結(jié)構(gòu)解析及抑制劑篩選。BAGV是一種黃病毒,以蚊蟲為傳播媒介,不僅引起了嚴(yán)重的禽類死亡,人體感染后還會引起腦炎。BAGV基因組編碼10種蛋白,包括3種結(jié)構(gòu)蛋白和7種非結(jié)構(gòu)蛋白。BAGV的NS3蛋白的C端在BAGV復(fù)制過程中起解旋酶的作用,利用ATP水解能量將病毒RNA雙鏈解開以幫助病毒進一步復(fù)制。該工作解析了BAGV helicase的晶體結(jié)構(gòu),揭示了該helicase中的NTP和RNA結(jié)合口袋,可作為抗BAGV藥物的靶點。基于該解旋酶的晶體結(jié)構(gòu),通過虛擬篩。⑾至20種同時靶向NTP結(jié)合位點和RNA結(jié)合位點的化合物。并通過分子對接、氨基酸突變分析、等溫滴定量熱法(ITC)和ATP酶活檢測,發(fā)現(xiàn)EGCG、Quercitrin、Citicoline sodium及Isochlorogenic acid C對BAGV解旋酶的雙靶點的親和力高,并能明顯抑制ATP酶的活性,因而這四種化合物可能是最有前景的BAGV抑制劑。該工作的亮點是發(fā)現(xiàn)了BAGV helicase的雙靶點抑制劑,這為推進針對BAGV以及其他黃病毒的創(chuàng)新藥物發(fā)現(xiàn)提供了新的策略。

圖2. 基于BAGV helicase結(jié)構(gòu)的虛擬篩選和分子對接發(fā)現(xiàn)BAGV的雙靶點抑制劑
(圖文/趙蓉)
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