乙肝病毒（HBV）感染是我國乃至全世界的一個嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題，是導(dǎo)致肝炎的主要原因之一，長期感染會導(dǎo)致肝纖維化、肝硬化甚至肝癌的發(fā)生,目前全球慢性HBV感染者約有2.5億人。HBV基因組DNA是一個松弛環(huán)狀的DNA（rcDNA），長度約3.2 kb。一旦感染細(xì)胞，rcDNA會進(jìn)入到細(xì)胞核并轉(zhuǎn)化為共價閉合環(huán)狀DNA（cccDNA），cccDNA是HBV所有病毒基因轉(zhuǎn)錄的模板，以微染色體的形式穩(wěn)定存在且難以清除，是HBV反復(fù)復(fù)發(fā)且難以清除的根本原因[1, 2], 因此研究HBV cccDNA轉(zhuǎn)錄調(diào)控的分子機(jī)制具有重要的科研價值和臨床研究意義。
2023年8月3日，清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院李海濤課題組、北京生命科學(xué)研究所/清華大學(xué)生物醫(yī)學(xué)交叉研究院李文輝課題組和清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院王大亮副教授合作，在Nature Communications雜志在線發(fā)表了題為"Molecular insights into Spindlin1-HBx interplay and its impact on HBV transcription from cccDNA minichromosome"（Spindlin1-HBx互作及其影響乙肝病毒閉合環(huán)狀DNA微染色體轉(zhuǎn)錄的分子機(jī)理解析）的研究論文，報道了HBV編碼的關(guān)鍵調(diào)控蛋白HBx如何通過劫持和利用表觀因子Spindlin1蛋白來攻克異染色質(zhì)障礙進(jìn)而促進(jìn)HBV cccDNA轉(zhuǎn)錄的分子機(jī)理。
該研究通過基于表面等離子共振成像（SPRi）技術(shù)的多肽陣列篩選[3]、等溫量熱滴定（ITC）和結(jié)構(gòu)生物學(xué)等方法發(fā)現(xiàn)HBx的N端保守序列（第2-21位的氨基酸，HBx2-21）可以與Spindlin1蛋白的第3個Tudor結(jié)構(gòu)域互作，并解析了Spindlin1-HBx2-21復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)。接著，通過結(jié)構(gòu)分析、生化結(jié)合以及細(xì)胞實驗發(fā)現(xiàn)，HBx蛋白與Spindlin1第3個Tudor的結(jié)合可以與Spindlin1第1和第2個Tudor結(jié)構(gòu)域?qū)M蛋白甲基化修飾的識別很好的共存。有意思的是，體外ITC實驗表明與HBx結(jié)合后，Spindlin1對組蛋白H3“K4me3-K9me3”二價修飾的識別能力提高了3.5倍，親和力高達(dá)3.8 納摩爾，是迄今報導(dǎo)的最強(qiáng)組蛋白修飾識別事件。接著，研究者利用李文輝教授課題組發(fā)現(xiàn)并建立的HBV感染HepG2-NTCP細(xì)胞模型[4, 5]開展了一系列功能實驗。研究表明Spindlin1-HBx互作可以促進(jìn)HBV cccDNA的轉(zhuǎn)錄，并且這種促進(jìn)作用與HBV cccDNA微染色體從H3K9me3標(biāo)志的異染色質(zhì)狀態(tài)向以H3K4me3和乙酰化修飾標(biāo)志的活躍染色質(zhì)狀態(tài)的轉(zhuǎn)變有關(guān)。值得一提的是，該研究還發(fā)現(xiàn)Spindlin1與HBx的N端保守序列互作會影響HBx蛋白構(gòu)象的改變，將HBx構(gòu)象從折疊的不活躍狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)樯煺沟幕钴S狀態(tài)，進(jìn)而促進(jìn)HBx與其它互作因子如DDB1 [6]和Bcl-2 [7]等的結(jié)合來協(xié)同調(diào)控HBV基因組的活化。
該研究揭示了Spindlin1與HBx蛋白互作的結(jié)構(gòu)基。雋薙pindlin1-HBx通過調(diào)控HBV cccDNA修飾狀態(tài)及HBx蛋白構(gòu)象改變進(jìn)而促進(jìn)HBV轉(zhuǎn)錄的分子機(jī)理。李海濤課題組致力于揭示表觀調(diào)控因子在遺傳信息解讀，以及癌癥、病毒和白血病等人類疾病發(fā)生中的作用機(jī)理。在此前的報道中，李海濤課題組發(fā)現(xiàn)表觀調(diào)控因子Spindlin1可以通過其第1和第2個Tudor結(jié)構(gòu)域識別多種組蛋白甲基化修飾模式，響應(yīng)不同的上游甲基化“書寫器”（writer）通路，識別不同基因組區(qū)段的H3K4me3修飾或修飾組合景觀，從表觀遺傳層面調(diào)控重要基因的表達(dá)[8, 9]。本研究闡明了Spindlin1蛋白3個Tudor結(jié)構(gòu)域可以協(xié)同作用共同促進(jìn)HBV cccDNA的轉(zhuǎn)錄，拓寬了領(lǐng)域內(nèi)對表觀調(diào)控因子在HBV生命周期中發(fā)揮的特異作用機(jī)制的理解，為靶向HBV慢性感染及相關(guān)疾病的治療提供了重要理論基礎(chǔ)。
清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院李海濤教授、北京生命科學(xué)研究所/清華大學(xué)生物醫(yī)學(xué)交叉研究院李文輝教授和清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院王大亮副教授為共同通訊作者，清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院李海濤課題組博士后劉偉和北京生命科學(xué)研究所已畢業(yè)博士生姚奇艷為本文的共同第一作者，清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院已出站博士后蘇曉楠和醫(yī)學(xué)實驗班2017級學(xué)生鄧雅方等人參與了本研究。前中科院納米所研究員朱勁松博士及其博士生楊墨在基于SPRi的多肽陣列篩選實驗中提供了重要技術(shù)支撐。
該工作得到國家自然科學(xué)基金委員會、國家重點研發(fā)計劃和北京市重大科技專項的資助。李海濤教授是清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心、北京生物結(jié)構(gòu)前沿研究中心、分子腫瘤學(xué)全國重點實驗室、教育部蛋白質(zhì)科學(xué)重點實驗室，以及c7c7.app-清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院前沿醫(yī)學(xué)協(xié)同創(chuàng)新中心成員。
原文鏈接：
https://www.nature.com/articles/s41467-023-40225-w
參考文獻(xiàn):
參考文獻(xiàn)
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