我校與合作者在肝細胞癌標志物及治療靶點方面取得進展
肝細胞癌(HCC)的早期診斷和靶向治療是提高HCC患者治愈率和生存率的主要途徑。研究發現CircRNAs或是一種頗具潛力的腫瘤診斷生物標記物和治療靶標。2019.2.4c7c7.app2016級微生物專業碩士研究生雷波等在CancerMedicine發表題為Circular RNA expression profiles of peripheral blood mononuclear cells in hepatocellular carcinoma patients by sequence analysis的研究論文。論文通過RNA-seq揭示了一種circRNA(circ_0000798)可作為HCC早期篩查標志物和治療的新靶點。該文由c7c7.app與陸軍軍醫大學合作完成,c7c7.app為第一產權單位。
本研究首先通過高通量RNA-seq技術,深度分析HCC特異差異表達的候選RNA分子,經擴大樣本RT-PCR驗證篩選出HCC特異高表達的circ_0000798。經Sanger測序驗證及統計分析證明circ_0000798與HCC肝硬化,腫瘤大小等顯著正相關,與患者生存時間顯著負相關,ROC曲線表明該分子可作為HCC早期診斷的標記物(相關成果已申請發明專利,實質審查階段)。
此外,該研究經生物信息學多維度分析表明circ_0000798可海綿多個HCC特異的miRNA分子,調控免疫效應分子IFNG,TNFAIP和ICAM1以及免疫調節分子FOS,BCL家族和SGK1等,解讀了circ_0000798對HCC病理的免疫調控作用,為后續靶向circ_0000798治療HCC奠定了基礎。

RNA-seq展示差異火山圖和熱圖

qRT-PCR及Sanger測序驗證結果

預后及ROC曲線展示